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Data
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Horário
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Assunto
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23/05
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08:00-12:00
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Apresentação
geral do curso e seus objetivos: varredura virtual usando com base
a estrutura dos ligantes , modelagem molecular clássica /
ligantes e estudo de caso de interação entre proteínas.
Apresentação
do
problema biológico usado na prática do curso. Concepção
de
fármacos contra o câncer utilizando o alvo a proteína HSP90.
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14:00–18:00
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Instalação
dos programas em computadores pessoais a
serem usados durante
o curso. Distribuição dos dados de HSP90 e
seus ligantes para uso na aula prática.
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24/05
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08:00-12:00
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Quimioinformática:
estruturas e representações químicas, descritores químicos,
medidas de similaridade química. Apresentação
do problema biológico usado na aula
prática, concepção de
fármacos contra o câncer utilizando o alvo a proteína HSP90.
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14:00–18:00
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construção
de uma
base de dados de ligantes conhecidos
para HSP90. Análise da diversidade química dentro deste banco de
dados.
Explorando outros bancos de dados.
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25/05
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08:00-12:00
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Métodos
para
explorar os ligantes que tem
como alvo os espaços conformacionais. Construir as bases de
dados 3D
para o VS. Estudos
Proteína/ ligante. Conexões com validações
experimentais.
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14:00–18:00
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Construir
a base de dados 3D de ligantes putativos HSP90 eo conjunto
conformacional para a proteína alvo. Análise da diversidade
química
dentro deste banco de dados.Explorar outros
bancos de dados.
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26/05
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08:00-12:00
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Virtual Screening (VS). Ancoragem molecular:
algoritmos, funções de pontuação, métodos de otimização,
estratégias VS (força bruta ou orientado). Ferramentas de VS
clássica, métodos de análise.
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14:00–18:00
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Exercícios
VS
visando o domínio HSP90 quinase. Análise dos resultados.
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27/05
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08:00-12:00
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Interações
proteína
/ proteína (PPI): pontos de detecção quente, padrões
de
superfície , forças de condução, campos eletrostáticos.
ferramentas
de investigação PPI. bibliotecas químicas dedicada
à PPI.
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14:00–18:00
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Construção
de
complexos PPI. Exercícios visando
estudar as
interfaces
HSP90 PPI. Análise dos resultados.
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